5.  按廠商指南用0.2~0.4 mm 均厚的墊片和大的書本裝訂夾子組裝凝膠膠模夾層，注意墊片與平板的邊、底壓緊對齊。

6.  制作每塊凝膠時，在100 ml 燒杯配制60 ml 所需的變性丙烯酰胺凝膠溶液，在灌膠（步驟7）前，*混勻60 μl TEMED和0.6 ml 10%過硫酸銨于每份丙烯酰胺溶液中。

7.  立即灌膠，用60 ml 注射器小心吸出丙烯酰胺溶液，避免吸入氣泡，讓短平板朝上， 并使凝膠平板夾層與臬面成45度角，沿著平板的一邊慢慢將丙烯酰胺溶液推入兩片平板之間，其間可調(diào)整角度讓膠液慢饅流入夾層的一邊。

8.  當溶液達到短平板的頂部時，放下膠模夾層至其頂部邊緣離操作臺平面仍有5 cm 左右，其下墊一空的吸頭盒或其他物件以使之保持較低的角度。

9.  將0.2~0.4 mm 厚的鯊魚齒樣品梳的平齊一側(cè)插入膠液中，至短平板下約2~3 mm，操作須十分小心以避免產(chǎn)生氣泡，用一個書本裝訂夾將平極之間的樣品梳夾緊，以避免在掩子與平板間形 成凝膠固塊。

10.  加一層過量的丙烯酰胺溶液至梳子，保證其被*覆蓋。用水沖洗注射器，除去過量的丙烯酰胺。

11.  除去每片膠模夾層的底部墊片或膠帶，用刀片除去樣品瓶周圍的過量聚丙烯酰胺凝膠。

12.  用水清洗平板表面溢出的尿素和丙烯酰胺溶液，從每片膠模夾層中撥去鯊魚齒樣品梳，避免拉傷凝膠頂部。

13.  用水清洗梳子，準備好在步驟16操作時重新插回樣品孔。如果用常規(guī)樣品梳，小心防止撕裂聚丙烯酰胺加樣孔，

14.  凝膠電泳裝置的下層貯液槽加入1XTBE緩沖液，使凝膠夾層能浸泡在2~3 cm 的一層緩沖液中，放入凝膠夾層并用夾子固定在電泳裝置上。

15.  上層貯槽倒入1×TBE緩沖液，使超過凝膠頂部約3 cm，用巴斯德吸管或Beral細管以1×TBE清洗凝膠頂部。

16.  將清洗干凈的鯊魚齒樣品梳重新播回凝膠夾層，使其齒部僅可觸及凝膠，用巴斯德吸管或Beral細管以1×TBE緩沖液*清洗加樣孔，以除去零星的聚丙烯酰胺碎片。

17.  加樣前，在45 V/cm 凝膠的電壓降下預電泳，使凝膠預熱，即在1 700 V，70 W 恒功率下電泳約30 min。

18.  在加樣前，清洗加樣孔除去浸進孔中的尿素。

19.  在甲酰胺/染料溶液中的樣品，蓋好蓋子，在95℃加熱2 min，然后置于冰上，每孔加 樣2~3 μl 測序用的加樣吸頭可于每次加樣后在下槽緩沖液中沖洗2次后繼續(xù)使用。

20.  在45~70 W 恒功率下電泳，凝膠溫度保持在約65℃。

21.  高于此溫度可能會造成玻璃平板炸裂或條帶彌散，而太低溫度可使測序產(chǎn)物不*變性、現(xiàn)察標志染料的遷移以確定電泳時間。

22.  將干冰加入干膠機的冷阱并預熱至80℃。

23.  電泳完畢時，排出上下液槽的緩沖液，并按放射性廢物處理丟棄液體。

24.  從電泳裝置中取出凝膠夾層，并在冷自來水下沖洗直至兩面玻璃平板表面都冷卻為止，將夾層平放在紙巾上，四口玻璃平板（短平板）朝上，除去多余的液體及夾子、膠帶，取出一邊的墊片。

25.  兩片玻璃平板之間插入一個長金屬鏟子，輕輕轉(zhuǎn)動鏟于將玻璃 平板橇起使之分開，凝膠應貼在下面的玻璃平板，如果貼在上面的平板，則將它翻轉(zhuǎn)過來。

26.  從插有鏟子的一邊饅慢提起上面的平板，遂漸增加角度直至上層平板*與凝膠分離。