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Get到這幾招,方可輕松搞定SDS-PAGE電泳實(shí)驗(yàn)!
發(fā)布時(shí)間: 2021-09-03 點(diǎn)擊次數(shù): 1278次SDS-PAGE 作為一個(gè)老生常談的實(shí)驗(yàn),早已廣為科研者所知。然而該實(shí)驗(yàn)雖然基礎(chǔ),但是細(xì)節(jié)繁瑣,耗時(shí)長(zhǎng)久,光是配制試劑就要花費(fèi) 2 個(gè)小時(shí)左右。而這還只是 Western blot(WB)的第一步,也使得完成 WB 實(shí)驗(yàn)將會(huì)耗費(fèi) 2 天左右的時(shí)間。 這也難怪科研者們常說,一入 WB 深似海,從此休閑是路人。不過,實(shí)踐出真知,長(zhǎng)期在該實(shí)驗(yàn)里跌爬滾打也總結(jié)出了若干小技巧,可使大家輕松快捷的完成該實(shí)驗(yàn)。
1、未雨綢繆,做好萬全準(zhǔn)備
常言道,不打無準(zhǔn)備之仗,方能立于不敗之地。實(shí)驗(yàn)中種種試劑、抗體等等均是完成實(shí)驗(yàn)這座大廈的基石,如果基石打不牢,實(shí)驗(yàn)很有可能會(huì)半路夭折。而實(shí)驗(yàn)中最痛苦的莫過于與實(shí)驗(yàn)結(jié)果就差那么一步之遙。
以 Western blot(WB)為例,這眼瞅著就要到條帶現(xiàn)身的奇跡時(shí)刻,卻愣是讓曝光試劑的匱乏給硬生生的截?cái)嗔艘娮C過程,又怎會(huì)不讓人懊惱上火呢?
其實(shí),上述窘境皆是科研者在實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備不足所致,若是能提前發(fā)現(xiàn)試劑的不足,或?qū)υ噭┲匦掠嗁?,又或者重新配制溶液,均能再次推進(jìn)實(shí)驗(yàn)進(jìn)程。然而就這訂購或配制試劑的過程無疑會(huì)消耗我們的時(shí)間以及精力。
那么為了避免原材料浪費(fèi)以及節(jié)省更多的時(shí)間,SDS-PAGE 電泳過程中的一些試劑還是早早的配制并妥善保存起來為好,如此方可以備不時(shí)之需。
緩沖液(buffer):
關(guān)于這一點(diǎn),你可能早已知曉,但再次重復(fù)一遍也不是壞事。實(shí)驗(yàn)中可將所有的凝膠緩沖液進(jìn)行一次性大量配制,如此可方便后續(xù)實(shí)驗(yàn)中對(duì)其的任意使用。至于配制的濃度,10x 濃度是實(shí)驗(yàn)室配制母液常用的濃度。有些實(shí)驗(yàn)室會(huì)多次重復(fù)利用這些凝膠電泳緩沖液,在這種情況下,建議每次使用 buffer 時(shí)均要在緩沖瓶上貼一個(gè)標(biāo)簽,已記錄使用的次數(shù),超過一定期限后就要對(duì)緩沖液進(jìn)行重新配制,以免對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果造成影響。
過硫酸銨(APS):
在接觸 SDS-PAGE 電泳之初,每次配膠時(shí)均會(huì)制備新鮮的 APS,可后來發(fā)現(xiàn)溶解后的 APS 在分裝后,可在-20℃冰箱中得以長(zhǎng)期儲(chǔ)存。另外,如果你需要經(jīng)常使用 SDS-PAGE 凝膠,那么可取出一只分裝后的 APS 溶液,將其置于 4℃冰箱里,可保證其一個(gè)月不會(huì)過期。
凝膠(gel):
凝膠是現(xiàn)用現(xiàn)配的好,已成為了各位心中的常識(shí),那么是不是就意味著凝膠不能提前制備么?其實(shí)不然,提前準(zhǔn)備好的凝膠在 4℃冰箱中大致可以保持兩周左右。但需要謹(jǐn)記的是在儲(chǔ)存凝膠時(shí),保持凝膠濕潤(rùn)是非常重要。可以將凝膠板、梳子甚至整個(gè)固定裝置都裝入一個(gè)充滿蒸餾水的塑料盒中,而后再將其放在 4℃冰箱中進(jìn)行保存。
樣品(sample):
大家都知道,制備好的蛋白樣品要放在-20℃冰箱中進(jìn)行存儲(chǔ),有時(shí)一些稀少珍貴的樣品甚至還要放在-80℃冰箱里保存。在此,建議在儲(chǔ)存近期就要進(jìn)行 PAGE 電泳的蛋白樣品時(shí),可將該蛋白樣品與 loading buffer 混合在一起,加熱變性之后再進(jìn)行儲(chǔ)存。如此就可以在上樣前,將蛋白樣品解凍并離心即可。用該法儲(chǔ)存樣品長(zhǎng)達(dá)一年的時(shí)間,且實(shí)驗(yàn)結(jié)果依然沒有被破壞。
2、改變分離膠的覆蓋液體
通常多數(shù)人在制備好分離膠后,會(huì)用蒸餾水覆蓋其上,以避免分離膠的高低不平。但是實(shí)際上,此時(shí)用異丙醇代替水的效果會(huì)更好,因?yàn)楫惐伎梢愿帽Wo(hù)凝膠,并使凝膠更快地發(fā)生聚合,進(jìn)而節(jié)省制膠的時(shí)間。
3、緩沖液不夠用?準(zhǔn)備些彈珠吧
有時(shí),實(shí)驗(yàn)過程中,你會(huì)忽然發(fā)現(xiàn)沒有足夠的電泳緩沖液,此時(shí)一個(gè)節(jié)省時(shí)間的方法就是在現(xiàn)有電泳緩沖液添加一些彈珠(是的,就是我們小時(shí)候曾經(jīng)玩過的),以提高緩沖液的高度水平來保證緩沖液能沒過上樣孔。 但是要確保這些彈珠是潔凈的,否則一旦其對(duì)上樣的蛋白樣品造成了污染,就不要妄想此次實(shí)驗(yàn)會(huì)得到一張漂亮的實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖片了。
4、傳輸緩沖區(qū)
每個(gè)做 SDS-PAGE 電泳的童鞋,只怕都擔(dān)心過內(nèi)腔中的電泳緩沖液會(huì)有所泄露,畢竟當(dāng)緩沖液水平降低過多,以至于不能達(dá)到覆蓋加樣孔時(shí),就會(huì)導(dǎo)致孔內(nèi)變得干燥,進(jìn)而使得凝膠電泳變得無法正常運(yùn)行。也許,有人會(huì)建議你,當(dāng)你發(fā)現(xiàn)緩沖液下降的太過厲害,則需要暫停電泳,打開電泳槽,重新給內(nèi)腔添加電泳液,而后再次開啟電泳過程??赡茈娪酒陂g你會(huì)多次重復(fù)該過程直至實(shí)驗(yàn)完成為止。
顯然,該方法需要大家時(shí)刻關(guān)注電泳槽內(nèi)腔類電泳液的高低水平變化,其實(shí)也是蠻費(fèi)時(shí)費(fèi)力的。而有個(gè)簡(jiǎn)單粗暴的做法,即一次性在內(nèi)腔外部也添加同水平的電泳液,如此便可以一勞永逸的解決內(nèi)腔電泳液泄露問題。
參考文獻(xiàn):SDS-PAGE Tips and Tricks to Save You Time
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